故事舞台是在距今为止遥远的未来，地上的生物沉入海底，被海底的微小生物所食变成无机物，经过长时间的结晶最终变成了宝石生命体一样的存在。拥有宝石身体的28人，为了抵抗打算将宝石人作为装饰的“月人”，而各自分配了战斗和医疗方面的职责。 一心打算和月人战斗，但却没有分配到任何职业的磷叶(Phosphophyllite)，被统领着宝石人的金刚先生拜托“编写博物志”。这时候他遇到了真正拥有强大实力，却因为会散发毒液，而被其他宝石人敬而远之的辰砂(硫化汞)，自此展开的故事……