24年前（113年），当白热化的“红河之战”即将重演持续千年的悲剧之时。突然降临的神秘势力以压倒性的力量将双方参战部队屠杀殆尽，人类军团不得不退到“叹息之渊”南方。大陆从此进入诡异的和平时期。137年，少年尼尔的家乡约克镇遭到神秘黑色蔓莎和血色怪物的袭击，他和他的蒸汽机器人G堪堪逃过了追杀，成了仅存的幸存者而逃往圣文迪斯。隔日，大批难民被恐惧驱赶，涌入圣文迪斯避难，却纷纷长出黑色花朵后暴毙。数个小时内，黑色花朵仿佛瘟疫在城内蔓延，死者不断增加，逃生的途径都被神秘力量封死。尼尔也被卷入恐怖的漩涡中，不得不面对这个世界的残酷与真实……